「朝遅刻してしまったから、その分残業しよう」あるいは、上司から、「遅刻したんだから、その分残業しろ」といわれて残業をした場合、残業代を割増賃金で支払わなければならないでしょうか？
この場合、遅刻した日に残業する限りは、割り増し賃金を支払う必要はありません（昭和２９年１２月２１日 基収６１４３号）。
なぜなら、労働基準法３２条２項が１日の労働時間の上限を８時間とし、これを超える場合に割増賃金が発生すると規定しているところ、遅刻した日に遅刻時間分残業する場合は８時間を超えないことになるからです。
具体的に考えてみましょう。
午前９時～午後６時までが所定の労働時間で、昼休みが１時間だとします。
朝１時間遅刻して１０時に出勤したため、午後７時まで残業することにしました（昼休みは１時間）。
そうすると、１日の労働時間は８時間で変わらないため、割増賃金は発生せず、通常の８時間分の賃金を支払えばよいということになります。
上記のとおり、割増賃金を支払わなくてよいのは、１日８時間という労働基準法の定める労働時間内だからなので、遅刻した分を別の日に残業して取り戻そうとした場合は、その残業した日の労働時間が８時間を超える場合には、割増賃金を支払う必要があります。